这几种说法当中，“二世/兄之子/子婴”一说较为流行。迄今为止，从东汉班固到近现代，多采用此说。学界中大都支持支持第一说，就连近几年修订出版的《辞海》和《辞源》这两部著名的大辞典，也都一致认为子婴是二世兄之子，并指出是扶苏之子（扶苏之长子）。
也有论者如杨善群、王蘧常等人支持第二说。论点包括：
子婴的遭遇、才干及影响力绝非秦二世或同辈所能及。
据《秦始皇本纪》、《李斯列传》记载，胡亥对待自己的兄弟绝不手软，子婴若为胡亥的兄长，为何能存活下来？秦始皇死时年仅50岁，扶苏年龄大约为30岁左右。而《秦始皇本纪》中叙述子婴与“其子二人”谋杀赵高（与《李斯列传》中所述杀赵高过程不同），其子年龄至少有15-20岁左右，推断子婴年龄当为35-40岁左右，比秦始皇小10-15岁左右，与扶苏年纪大致相当。
在两汉时期的史书《史记》、《汉书》原文及《史记》三家注、颜师古注并无提及子婴为扶苏之子。
尚有学者李开元、马百非等人提出第四说，论点如下：
有关《李斯列传》集解引徐广说“一本曰‘召始皇弟子婴，授之玺’”中的“弟子婴”，应理解为“弟弟的儿子婴”。但秦始皇的弟兄见于文献记载的只有成蟜、母赵姬与嫪毐所生二子。所以被认为是成蟜的儿子。
《释名释长幼》：“人始生曰婴”。“婴”之名，有初生儿，年幼儿的含义。
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