建炎元年六月初，群臣百官择良辰吉日，三娘在南京开封登基称帝，定国号元，立扈宗明为皇太子，另一个养子扈宗睿为睿亲王，大封百官，封赏北伐凯旋将士，追赠、抚恤在北伐及抗金战争中死伤的将士们。
登基之后，三娘命朱武先期北上，统筹营建、治理燕京，准备来年迁都燕京。其余百官皆在开封继续署理政务，只因大元朝新立，人事变动，加上一场大战后，许多事都需要料理首尾。
岳飞留在北疆出任辽东、辽西、会宁三行省总督，兼任三省兵马总管，三娘给他派去了许多文官，辅佐岳飞治理三处新占领的行省。
退位后，三娘下旨依旧准许宋室一干宫眷仍旧居住宫中，只因三娘除了皇太子扈宗明和家人扈太公之外，其实并无自己的眷属，用三娘的话来说便是住在一起热闹些，充实宫中，否则偌大皇宫只有扈家居住，显得太冷清。
扈太公年岁已高，双目渐渐失明，三娘用尽办法也不能救回，只因以现在的医学水平，三娘还难以做换眼角膜手术。扈太公虽然失明，但三娘做了皇帝，按例尊奉扈太公为上皇，而扈太公坚辞不授，三娘也只得作罢，或许只有太公百年之后，再行追封了。
扈成则得封亲王，但没有署理什么要害的官职，只是做了宗正府的宗正，负责管理宗室、宗室财产并全国爵位的继承碟文等等，算是个闲散王爷。
扈宗睿则封了睿亲王，这小子已经十六岁，此前跟随北伐军出征过，他的志向乃是征战，是以三娘命他到西北大都督史进麾下效力。
卢俊义为枢密院副使，虽然上面还有个种师中为枢密使，但种师中年老，上一趟北伐遭遇严寒之后，便风寒入体，得了很严重的肺炎，一直没有痊愈，而种师中也知道天下的兵权也非自己能驾驭，于是趁着养病提出请辞，但三娘不准，仍旧命他顶着枢密使的头衔，只是准许他告病在家，长期休养。
卢俊义掌握枢密院，穆弘掌兵部，在三娘授意下，对天下五大军区主将人选做了极大调整，史进出任西路军区主帅兼任西北三省总督，专司对西夏防范，麾下统领秦明，黄信，李逵，鲁智深，武松，杨雄，石秀，孙新，孙立，欧鹏，邓飞，鲍旭，项充，李衮，穆春，孔明，孔亮，马麟，施恩，薛永，凌震。
自秦明一下军将都得封西北诸省军事大将，统管一方军事，西北路军事都在积极备战，参谋部分析，元夏迟早有一战。
北路军区自然是岳飞署理，同时兼任三省总督，麾下便是牛皋、张宪、王贵等岳飞一干兄弟，也都是出任北面三省军事主将，主要防备蒙古诸部并对北疆残余的金辽势力进行清剿。
东路军区乃是花荣出任主帅，麾下有卞祥、叶清、山士奇等原来田虎麾下降将，负责镇守东路各省。中路军区乃是栾廷玉出任主帅，麾下多是梁山旧部。
南路军区则是董平为主帅，麾下有张清，索超，解珍，解宝，郑天寿，龚旺，丁得孙，邹渊，邹润，李立，李云，焦挺，石勇，曹正，白胜，蔡福，蔡庆。这一路军区也是厉兵秣马，三娘对于宋太祖玉斧划江很有意见，大理国也该并入中华版图才是，是以董平出任南路主帅，便是要待合适时机便出兵大理。大理国现在乃是高氏权臣掌国，只要联络上段氏，清君侧什么的出兵借口可是大把的。但三娘还是希望先北后南，等收拾了西夏之后，再吞并大理国。
五路军区都安排妥帖，天下军马领军大将也都安然换成自己亲信领军，各地文官借着肃清吏治也换了个遍，三娘立国后总算是稳定了国内的局面，同时外患也因为金国覆灭而消除，元朝一改宋朝的软弱，开始积极准备对外扩张。
匆匆数月过去，转眼便过了岁日，时光来到了宣武元年。到了五月份，燕京在朱武治理下，迁徙了许多人口前去，有河北的难民也有辽地受灾的灾民，充实了燕京人口，又召集难民以工代赈修缮燕京城墙、宫殿，疏浚河道，已然初具规模。
便在宣武元年五月，元朝开国女帝迁都燕京，改燕京为中京，宣示中原王朝对北面疆域的强势管治时期开始。
迁都之后，三娘加强对西夏周边部族的分化瓦解，挑拨西夏国内君臣矛盾，加上元朝占据横山，对西夏虎视眈眈。西夏嵬名承景此时已经凭借军功得了国中实权，眼见元朝威逼，数次派遣使节朝贡元朝，希望能避免元朝的进攻。
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